管理科学与工程系成立于1995年，是由原管理工程教研室的一部分及原系统工程教研室组成。目前拥有专业教师28人，其中教授9人（博导9人），副教授10人，博士/讲师9人。教师中1人入选爱思唯尔（Elsevier）2014年中国高被引学者榜单，1人入选爱思唯尔（Elsevier）2018年中国高被引学者榜单，2人获评教育部新世纪优秀人才，2人获评北京市教学名师。本系96%的教师具有博士学位，80%的教师具有海外学习或进修经历。
本系现设有1个“管理科学与工程”一级学科博士点，2008年获得北京市重点学科称号，2009年设立管理科学与工程博士后流动站，1个“管理科学与工程”硕士专业和1个工程管理硕士专业（工业工程与管理、商务分析方向），2个本科生专业“信息管理与信息系统”与“大数据管理与应用”，“信息管理与信息系统”专业是2019年教育部首批国家一流专业建设点，以前曾获得北京市特色专业称号；“大数据管理与应用”专业是教育部第二批备案批准的新专业。目前，学科研究方向主要有商务数据分析、现代生产运营管理、新一代信息技术与信息管理、供应链管理与智能决策分析、先进制造系统优化与仿真、管理过程优化、复杂工程系统健康管理、企业电子商务与信息战略等。本系培养掌握现代管理理论、熟悉数字时代信息管理技术与方法，大数据技术和智能管理决策方法，解决现代组织面临的数字化管理转型、工业化与信息化融合的问题，有效运用组织内部、外部信息资源来实现管理战略，实现商业智能化决策的高级专门人才。本系致力于培育“基础实、能力强、适应广”的创新与实践并重的复合型高级专门人才。
本学科专任教师主持国家级、省部级和企事业单位科研项目共计120多项，其中，国家自然科学基金项目23项（其中1项结题为特优），其中包括2项国家自然科学基金重点项目和1项重大国际合作项目；此外，省部级项目33项，企事业单位的横向项目24项。在论文发表方面，国内外核心期刊上发表学术论文345篇，其中SCI/SSCI期刊87篇、国家自然科学基金委管理科学部重点期刊55篇。研究成果发表在Production and Operations Management，Decision Support Systems，IEEE Transactions on Industrial Electronics，Transportation on Research Part E-Logistics and Transportation Review，Integrated Computer-Aided Engineering，IEEE Transactions on Cybernetics，Reliability Engineering & System Safety，Computers & industrial engineering，European Journal of Operational Research，International Journal of Production Research，International Journal of Production Economics，Expert Systems with Applications，以及《管理科学学报》、《系统工程理论与实践》等国内外顶级期刊，达到一流的专业研究水平。
系主任： 杨建华
支部书记：杨建华
副主任： 葛泽慧
副书记： 王柏琳